GenoScreen a développé un laboratoire de biologie moléculaire de pointe pour l'exploitation et l'analyse de l'ADN. Nos équipes travaillent avec une large gamme étendue de technologies afin de réaliser des analyses optimisées sous contrôle qualité.
Notre laboratoire est doté d'un plateau technique complet avec des robots de dernière génération (Illumina, Applied Biosystems® - Life Technologies, Tecan, Hamilton, Opentrons...)
GenoScreen bénéficie aussi de l’accès à un laboratoire de haute sécurité P3 permettant la manipulation de pathogènes de niveau 2 et 3 (Anthrax, ESB, virus West Nile, SRAS, tuberculose, typhus, fièvre jaune...)
Plateforme Sanger
Séquenceurs capillaires 3730XL (Applied Biosystems®)
Plateforme de séquençage de seconde génération (NGS)
Accès à l’ensemble des plateformes basées sur la technologie Illumina (Miseq, Novaseq, etc.)
Plateforme de séquençage de troisième génération
- GridION (Oxford Nanopore Technologies)
- Sequel IIe (PacBio)
Plateforme de PCR quantitative et de génotypage
7900 HT (Applied Biosystem)Outils bioinformatiques
GenoScreen, à travers ses serveurs, dispose d’une puissance propre de calcul de plusieurs centaines de processeurs logiques. A travers le développement de suites logicielles et de pipelines, nos bioinformaticiens ont développé, à partir des suites logicielles de référence, des pipelines automatisés d’analyses génomiques et métagénomiques pour une analyse robuste, rapide et complète :
- Suite logicielle Deeplex® pour l'étude des microorganismes isolés,
- Classification taxonomique,
- Métagénomique fonctionnelle,
- Métatranscriptomique,
- Assemblage de novo,
- Analyse d’expression différentielle de gène,
- Recherche de variants (SNP, Indels, variants structuraux),
- Phylogénie,
- Recherche de gènes d’intérêt.