Séquençage ciblé

 

Le séquençage ciblé vous permet d'analyser spécifiquement les régions d'intérêt de votre génome. En réduisant les zones séquencées par enrichissement ou amplification ciblés, cette approche vous permet de réaliser des analyses de grande ampleur. Ces analyses peuvent être menées sur des populations d'individus, comme par exemple dans le cadre d'études d'association, pour l'identification de marqueurs génétiques d'une pathologie.

Grâce à son expérience, notre équipe vous conseillera sur la meilleure combinaison de technologies pour les étapes d'enrichissement custom (Nimblegen, Agilent), d'amplification ciblée (HaloPlex, Raindance, Multiplicon) avec les séquenceurs GsFLX/GsJunior ou HiSeq2500/MiSeq, et ce, en fonction de la quantité d'échantillons que vous souhaitez analyser et la taille de votre région d'intérêt.

Exome

Le séquençage d'exome vous permet d'analyser les zones codantes et séquences UTR de vos cohortes d'échantillons afin d'identifier des modifications communes ou rares de type SNPs, mutations et InDels dans le cadre de vos études d'association, études épidémiologiques, essais cliniques, pharmacogénétique et pharmacogénomique.

Fort de son expertise dans le domaine de la génétique humaine, notre équipe vous fournira une prestation de qualité en combinant les technologies de capture TruSeq (Illumina) ou SureSelect V5/V5+UTR (Agilent) avec la technologie HiSeq2500 (Illumina). Notre offre inclut l'analyse de vos données grâce à un pipeline bioinformatique standardisé développé en interne qui vous permettra de recevoir la liste des évènements communs ou rares identifiés dans vos échantillons.

 

Chip-Seq

Le séquençage ChipSeq a pour objectif d'isoler sur un génome les régions, souvent promotrices, qui interviennent dans la régulation des gènes. Elles contiennent des séquences consensus sur lesquelles un facteur de transcription vient favoriser ou inhiber l'expression d'un gène.
Savoir où se trouvent ces sites consensus et à quels gènes ils sont associés permet de déterminer le lieu d'action de facteurs de transcription dans le génome.

 

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