Séquençage de novo


L'approche dite de séquençage "de novo" vous permet de séquencer des génomes inconnus n'ayant pas de référence disponible dans les bases de données mais aussi de mieux caractériser des génomes complexes ou présentant des restructurations physiques.


Nos équipes vous conseillent sur la technologie ou la combinaison de technologies à adopter en fonction de l'objectif de votre projet ainsi qu'en fonction de la taille et de la complexité de votre génome d'intérêt.

Classiquement, l'approche de séquençage de novo se base sur l'utilisation du séquenceur GsFLX qui fournit des reads longs, associés à des préparations de librairies en Shotgun ou Paired-End 8 ou 20kb. Selon l'objectif de votre projet et la taille de votre génome, nous pourrons y associer des reads plus courts obtenus sur Hiseq2500 ou des reads Sanger.


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