GENO SAT®

Banques et Génotypage de Microsatellites


Production de banques de microsatellites
par séquençage haut débit

 - Une méthode standardisée

Basée sur le séquençage haut débit, la technique* a été validée sur plus de 400 espèces différentes chez Genoscreen.

 - Une efficience record

A partir d’1 µg d’ADN génomique, Geno Sat® permet d’obtenir un minimum de 8 000 séquences brutes, 2000 séquences contenant des motifs microsatellites et 100 couples d'amorces validés bioinformatiquement encadrant des motifs microsatellites, le tout dans un délai record de 2 mois.

 - Des données prêtes à être publiées

Notre Offre

En fonction de vos objectifs, Genoscreen vous propose une solution simple, attractive et modulable déclinée en 3 formules: 

 > GENO SAT®

Production de la banque de marqueurs microsatellites par pyroséquençage à ultra haut-débit (GS FLX®, Roche Diagnostics®). Obtention d'un minimum de 100 couples d'amorces validés bioinformatiquement et encadrant des motifs microsatellites.

 > GENO SAT® PACK

GENO SAT® 

+

Validation biologique des couples de primers par PCR et dépôt sur gel d'agarose

+

Etude de polymorphisme des couples validés biologiquement par PCR avec des amorces marquées (6FAM/VIC/NED/PET) et analyse des fragments sur séquenceur cappilaire (3730XL®, Applied Biosystems®)

 > GENO SAT® PACK PLUS: Génotypage de microsatellites

GENO SAT® PACK

+

Génotypage sur une large population d’individus à partir des marqueurs polymorphes validés par analyse de fragments sur séquenceur capillaire
(3730XL®, Applied Biosystems®)

Nous vous proposons la définition des conditions optimales d'analyse des microsatellites: 

  • Mise au point et optimisation de PCR multiplexées ou pool de différents produits PCR avant migration sur séquenceur capillaire
  • Génotypage des échantillons sur séquenceur capillaire et analyse des génotypes associés
  • Fourniture du marqueur de taille pour la migration (GeneScan 500 LIZ)
  • Combinaisons de fluorophores ppossibles: 6FAM-VIC-NED-PET
  • Stockage des échantillons d'ADN pendant 4 semaines après le rendu des résultats
  • Confidentialité des informations reçues et résultats obtenus

Nous prenons également en charge chaque étape de l'offre individuellement (validation biologique / étude de polymorphisme / mise au point de multiplexes / génotypage de populations avec ou sans analyse)

N'hésitez pas à nous contacter pour plus d'informations
sur GENO SAT
®

* Procédé GENOSCREEN – INRA – Montpellier SUPAGRO– Université de Provence.